橡胶树参考基因图谱达到染色体级

日前，由中国科学院昆明植物研究所、云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术，获得达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列；该研究历时6年，获得的基因组图谱在组装准确性与完整性上都得到了极大的提升，将组装获得的约1.47Gb的基因组序列挂载到了18条假染色体上。

橡胶树的高产、抗病、抗旱、抗寒等重要经济性状的基因组选择育种与优异基因资源的发掘利用，也亟需获得达到染色体级别的高质量橡胶树参考基因组图谱。该研究获得的参考基因组序列是国际上首次达到染色体级别的基因参考图谱，揭示大戟植物基因组的染色体进化、胶乳生物合成与橡胶树的驯化。构建了第一张代表性野生和栽培橡胶树的基因组变异精准图谱，获得约1570万个高质量的SNPs；解析了胶乳生物合成途径及重要基因的表达式样，发现与基础代谢过程、乙烯生物合成以及与乳胶停排相关的多糖和糖蛋白凝集素活动相关基因的显著扩张。

中国的橡胶种植面积达114万公顷，居亚洲第三位(仅次于印度尼西亚和马来西亚)，，云南的橡胶树种植总面积、总产量和单位面积产量均居中国首位，但年产不足。巴西橡胶树这一重要参考基因组的获得、胶乳生物合成代谢通路的解析、栽培和野生橡胶树基因组变异精准图谱的构建以及栽培橡胶树驯化的认识，对中国未来橡胶优异种质资源的保护、发掘与育种利用具有重要意义。